18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1275 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  100 
 
 
55 aa  110  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  76.36 
 
 
55 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  85.45 
 
 
57 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  85 
 
 
56 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  87.04 
 
 
62 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  62.26 
 
 
57 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  58.33 
 
 
52 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  54.72 
 
 
57 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  58.33 
 
 
55 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  61.9 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  58.33 
 
 
53 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  56.25 
 
 
50 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  58.7 
 
 
54 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  57.78 
 
 
56 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  56.82 
 
 
54 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  53.7 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  48 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  46.81 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>