18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1162 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  100 
 
 
62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  75.93 
 
 
55 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  79.25 
 
 
57 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  89.74 
 
 
56 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  87.04 
 
 
55 aa  72.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  61.11 
 
 
57 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  53.7 
 
 
57 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  57.14 
 
 
52 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  64.58 
 
 
53 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  60.42 
 
 
55 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  69.05 
 
 
62 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  58.33 
 
 
50 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  59.57 
 
 
54 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  57.45 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  55.32 
 
 
56 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  45.28 
 
 
55 aa  52  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  56.82 
 
 
54 aa  52  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  53.7 
 
 
57 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>