40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1083 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1083  siroheme-sulfite reductase gamma subunit-like protein  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.854921  normal  0.0420669 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1963  siroheme-sulfite reductase gamma subunit-like protein  65.18 
 
 
112 aa  170  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0558809  hitchhiker  0.00000000000146375 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2146  siroheme-sulfite reductase gamma subunit-like protein  63.06 
 
 
112 aa  160  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1442  DsrC family protein  33.03 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.486208 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0910  DsrC family protein  33.94 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1227  DsrC family protein  32.11 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.214898  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  31.78 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0347  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  31.19 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0220542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0168  DsrC family protein  31.19 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  30.91 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  29.59 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  27.18 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.43 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  31.07 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  27.45 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  29.35 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  34.25 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0635  DsrC-like protein  29.41 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1805  DsrC-like protein  34.29 
 
 
112 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0038276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  28.44 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508845  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  30.99 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  26.36 
 
 
111 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  29.25 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  26.09 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  30.88 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  37.7 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  37.7 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  37.7 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  35.38 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3341  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  35.38 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  33.85 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1739  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  25.93 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  35.38 
 
 
109 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  35.38 
 
 
109 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  27.17 
 
 
111 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  35.38 
 
 
109 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  35.38 
 
 
109 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  35.38 
 
 
109 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  35.38 
 
 
109 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>