18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0601 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  115  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  85.37 
 
 
57 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  81.4 
 
 
55 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  85 
 
 
55 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  89.74 
 
 
62 aa  73.2  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  66.67 
 
 
52 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  66.67 
 
 
57 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  69.05 
 
 
57 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  58.54 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  61.9 
 
 
62 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  57.14 
 
 
50 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  60.98 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  54.76 
 
 
56 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  58.54 
 
 
54 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  66.67 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  52.5 
 
 
54 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  47.5 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>