56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1321 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1321  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2774  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.11 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000890852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1516  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.69 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0739061  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.44 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0849  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.73 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4811  putative oxidoreductase subunit  23.57 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.57 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  22.7 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4663  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.48 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02675  hypothetical protein  23.72 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02713  predicted oxidoreductase  23.72 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0812  selenate reductase, FAD-binding subunit  23.72 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3040  putative selenate reductase subunit YgfM  23.72 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3206  putative selenate reductase subunit YgfM  23.72 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3013  putative selenate reductase subunit YgfM  23.72 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4170  putative selenate reductase subunit YgfM  23.72 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20080  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  24.14 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0549265  hitchhiker  0.0021832 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  21.74 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.38 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000220689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.45 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.01 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2881  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  21.97 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  23.42 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.37 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.3 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.79 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1784  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.94 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4200  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  20.22 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.690695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  20.07 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1633  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.18 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2511  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.99 
 
 		 325 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.09 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0060  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.67 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  23.13 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.12 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.46 
 
 		 286 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.23 
 
 		 281 aa  48.5  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.15 
 
 		 484 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.86 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  23.75 
 
 		 484 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0828  putative selenate reductase subunit YgfM  23.51 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  23.75 
 
 		 484 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.9 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  23.51 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  30.6 
 
 		 499 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  21.99 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4724  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  19.49 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0928785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.71 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1871  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  19.78 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00397526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  23.08 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  23.49 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.35 
 
 		 479 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0059  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.2 
 
 		 278 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.03 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2530  putative carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit  19.48 
 
 		 272 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0576667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>