34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2851 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  100 
 
 
116 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  55.96 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  55.08 
 
 
121 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  57.45 
 
 
115 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  47.52 
 
 
120 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  46.9 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  63.89 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  46.53 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  44 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  44.12 
 
 
112 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  47.96 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  47.78 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  43.14 
 
 
119 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  44.86 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  48 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  54.05 
 
 
127 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  42.99 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  53.25 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  50.63 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  41.41 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  42.31 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  43.3 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  35.42 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  37.36 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  41.46 
 
 
119 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  42.05 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  48.89 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  48.89 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  48.89 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  46.67 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  37.84 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2762  hypothetical protein  35.05 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0682  hypothetical protein  37.33 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>