13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1103 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1103  addiction module component  100 
 
 
73 aa  143  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  60.87 
 
 
74 aa  91.7  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2635  addiction module component, TIGR02574 family  45.59 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.476952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  38.81 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  42.19 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  41.1 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  34.33 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4757  hypothetical protein  34.33 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127929  hitchhiker  0.00000000461587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  33.87 
 
 
72 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  36.36 
 
 
88 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>