18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2993 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2993  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4233  hypothetical protein  47.13 
 
 		 220 aa  137  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0348  hypothetical protein  36.31 
 
 		 319 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1322  hypothetical protein  38.62 
 
 		 277 aa  88.6  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0810  hypothetical protein  32.4 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0562  hypothetical protein  33.88 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0052  hypothetical protein  37.18 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01410  hypothetical protein  30.6 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1590  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3141  hypothetical protein  27.34 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4600  hypothetical protein  27.03 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4348  hypothetical protein  29.02 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.915436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2209  hypothetical protein  36.76 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 640 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34610  hypothetical protein  33.59 
 
 		 263 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 639 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0974  hypothetical protein  41.57 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1437  hypothetical protein  30 
 
 		 201 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>