25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1252 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1252  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  380  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1253  hypothetical protein  53.01 
 
 
443 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1963  hypothetical protein  41.75 
 
 
247 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1255  hypothetical protein  47.13 
 
 
197 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0983588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1586  hypothetical protein  46.72 
 
 
218 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2936  hypothetical protein  44.08 
 
 
306 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1254  hypothetical protein  45.75 
 
 
143 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1584  hypothetical protein  39.38 
 
 
351 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2939  hypothetical protein  45.39 
 
 
159 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2937  hypothetical protein  41.06 
 
 
150 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.966639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1318  hypothetical protein  49.07 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2933  hypothetical protein  42.76 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1326  hypothetical protein  41.67 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2938  hypothetical protein  42.86 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1317  hypothetical protein  38.16 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1327  hypothetical protein  52.78 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.361966  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1585  hypothetical protein  44.71 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.338245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2934  hypothetical protein  38.58 
 
 
143 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1463  hypothetical protein  42.7 
 
 
95 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1325  hypothetical protein  52.7 
 
 
291 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  31.93 
 
 
238 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1256  hypothetical protein  54.72 
 
 
56 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  36.89 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  32.92 
 
 
282 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1595  hypothetical protein  44.44 
 
 
101 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0305449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>