18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1177 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  614  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  52.74 
 
 
302 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  45.24 
 
 
296 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  44.44 
 
 
304 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  39.31 
 
 
286 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  34.97 
 
 
290 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  35.69 
 
 
299 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  31.25 
 
 
286 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  36.6 
 
 
301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  35.27 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  33.91 
 
 
291 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  32.75 
 
 
298 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  30.28 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2159  hypothetical protein  23.43 
 
 
313 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.290579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  29.14 
 
 
332 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  29.2 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>