18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3163 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  52.74 
 
 
305 aa  299  5e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  36.7 
 
 
296 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  39.93 
 
 
286 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  34.28 
 
 
290 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  33.56 
 
 
299 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  35.47 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  35.19 
 
 
291 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  34.07 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  32.76 
 
 
294 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  28.62 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  30.51 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  23.92 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2159  hypothetical protein  23.05 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.290579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  21.38 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  40.24 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  29.58 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>