24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1067 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1067  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  306  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0843  hypothetical protein  66 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2083  hypothetical protein  38.97 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1450  hypothetical protein  37.39 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1520  hypothetical protein  38.03 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00240031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2595  hypothetical protein  35.37 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3126  hypothetical protein  34.56 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.336493  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4571  hypothetical protein  34.53 
 
 
174 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6228  normal  0.0680023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37010  conserved hypothetical protein TIGR00026  34.31 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3003  hypothetical protein  33.81 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.793652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1792  hypothetical protein  33.85 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3957  hypothetical protein  33.82 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19300  hypothetical protein  38.39 
 
 
149 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261784  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2859  hypothetical protein  29.32 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2903  hypothetical protein  29.32 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2889  hypothetical protein  29.32 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0682  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0239425  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3168  hypothetical protein  28.03 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460452  normal  0.10109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3415  hypothetical protein  27.82 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0681528  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3245  hypothetical protein  34.51 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00724538  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0702  hypothetical protein  38.33 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.149977  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0689  hypothetical protein  38.33 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1141  hypothetical protein  38.1 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0024  hypothetical protein  30.25 
 
 
130 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441006  normal  0.869283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>