18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4948 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4948  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5271  hypothetical protein  52.79 
 
 
196 aa  227  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0885662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0576  hypothetical protein  47.5 
 
 
197 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0559  hypothetical protein  47.5 
 
 
197 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5152  hypothetical protein  44.67 
 
 
220 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0443  hypothetical protein  44.15 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0130  hypothetical protein  43.75 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1018  hypothetical protein  27.22 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49879  predicted protein  29.63 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0341  hypothetical protein  24.71 
 
 
190 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1481  hypothetical protein  26.92 
 
 
165 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.141133  normal  0.453845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05201  hypothetical protein  26.63 
 
 
173 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03731  hypothetical protein  26.7 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11941  hypothetical protein  26.7 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.340527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0475  uncharacterized membrane protein  26.7 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0634074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03721  hypothetical protein  24.43 
 
 
161 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06261  hypothetical protein  26.32 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8654  normal  0.165246 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03751  hypothetical protein  29.35 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>