92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4776 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  44.53 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  47.22 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  31.94 
 
 
173 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  40.52 
 
 
151 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  42.5 
 
 
167 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.14 
 
 
171 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  39.42 
 
 
165 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  40.71 
 
 
151 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  41.74 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  47.11 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  41.74 
 
 
147 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  40.87 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  45.95 
 
 
146 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  32.67 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  39.69 
 
 
150 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  39 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  34.07 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  29.38 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  42.7 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  25.82 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  27.75 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  34.91 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  30.71 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  31.01 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  30 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  31.3 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  29.2 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  31.48 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  28.79 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  46.58 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  37.21 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  37.21 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  28.65 
 
 
191 aa  64.3  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.54 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  27.91 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.54 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  36.78 
 
 
218 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  29.73 
 
 
172 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  27.78 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.19 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  27.21 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  33.9 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  36.54 
 
 
210 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  25 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  28.68 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  29.27 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  24.78 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  23.89 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  27.98 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  31.39 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  31.45 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  38.02 
 
 
180 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
395 aa  54.7  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  30.43 
 
 
397 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  22.56 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  27.61 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  30.4 
 
 
179 aa  51.6  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  26.75 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  30.97 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  31.03 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  32.2 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  28.03 
 
 
171 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  29.03 
 
 
174 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  30.63 
 
 
169 aa  48.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  26.09 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
401 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  29.66 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  27.46 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3259  hypothetical protein  23.57 
 
 
144 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  25.78 
 
 
163 aa  45.1  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  28.18 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  31.82 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  31.53 
 
 
168 aa  44.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  26.32 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  32.67 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  29.73 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  35.21 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  24.62 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  29.73 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  27.27 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  29.73 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  29.09 
 
 
169 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  29.09 
 
 
169 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  28.69 
 
 
174 aa  41.6  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  29.51 
 
 
176 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  29.73 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>