23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3873 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3873  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  321  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0574079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4794  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 
156 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.70045  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34088  predicted protein  27.46 
 
 
183 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0723  amino-acid acetyltransferase  31.62 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4245  N-acetylglutamate synthase  31.78 
 
 
445 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0405  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104668  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0391  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00634801  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0379  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0107482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0380  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
439 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000181036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0465  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
439 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000881657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3767  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
445 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.078519  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0362  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
445 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3594  N-acetylglutamate synthase  30.84 
 
 
445 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0330  N-acetylglutamate synthase  31.37 
 
 
440 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000023217  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3478  N-acetylglutamate synthase  30.39 
 
 
440 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  33.93 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1522  N-acetylglutamate synthase  30.11 
 
 
438 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4558  N-acetylglutamate synthase  31.37 
 
 
439 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108665  hitchhiker  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
140 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
164 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0329  N-acetylglutamate synthase  30.39 
 
 
439 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.758778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>