15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2397 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2397  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.681747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1282  putative transposase  50.67 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312263  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2299  putative transposase  50.67 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2855  putative transposase  50.67 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.698297  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3056  putative transposase  50.67 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.558452  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1694  putative transposase  50.67 
 
 
119 aa  77  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0919099  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1311  hypothetical protein  41.1 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5856  transposase, putative  45.21 
 
 
110 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5654  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115852 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5860  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5877  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000541251 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5874  hypothetical protein  45.21 
 
 
292 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00111277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3103  hypothetical protein  43.84 
 
 
292 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5767  transposase, putative  44.44 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2958  putative transposase  48.78 
 
 
44 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0180771  normal  0.0609062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>