14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2166 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2166  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0350  hypothetical protein  43.31 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0301232  normal  0.125354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1134  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 286 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1164  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 286 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1228  hypothetical protein  46.27 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1258  hypothetical protein  46.27 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000323841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0878  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.59 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.213788  hitchhiker  0.0000283657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  33.94 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  37.6 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  44.32 
 
 		 300 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1821  hypothetical protein  31.36 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867185  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3521  TPR domain protein  36.21 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  48.48 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2280  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 310 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>