12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0054 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0024  tRNA-Leu  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283238  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
73 bp  56  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0046  tRNA-Leu  89.36 
 
 
74 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.745536  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  94.12 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0038  tRNA-Leu  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.726188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20260  tRNA-Leu  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0032  tRNA-Leu  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421974  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0026  tRNA-Leu  96.3 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>