13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1753 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  37.9 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  36.3 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0412  hypothetical protein  39.62 
 
 
817 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  31.34 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  43.53 
 
 
173 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3865  hypothetical protein  31.3 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  55.26 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  32.82 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  51.28 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  29.63 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3755  hypothetical protein  31.01 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  27.45 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>