11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1604 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1604  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  881    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6917  hypothetical protein  49.77 
 
 
441 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5727  hypothetical protein  36.23 
 
 
614 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  36.2 
 
 
815 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6957  hypothetical protein  33.78 
 
 
652 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  34.64 
 
 
794 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1515  hypothetical protein  32.51 
 
 
795 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 
781 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5109  hypothetical protein  30.38 
 
 
583 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2364  hypothetical protein  31.71 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0996966  hitchhiker  0.00832001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  32.14 
 
 
723 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>