17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1541 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 193 aa  373  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  43.41 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  45.1 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  44.67 
 
 		 171 aa  99.4  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  49.09 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  56.34 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  34.19 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  38 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  38.69 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  29.34 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  38.36 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3386  rod shape-determining protein MreD  39.58 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.266152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  38.46 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  28.87 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  33.87 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  30.83 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  29.93 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>