53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0814 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  51.18 
 
 
857 aa  659    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  54.25 
 
 
789 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  100 
 
 
790 aa  1486    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  43.63 
 
 
837 aa  491  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  45.09 
 
 
789 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  42.44 
 
 
751 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  42.27 
 
 
752 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  39.7 
 
 
876 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  43.76 
 
 
747 aa  426  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  44.91 
 
 
761 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  42.84 
 
 
758 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  41.48 
 
 
820 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  37.78 
 
 
758 aa  349  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  37.94 
 
 
759 aa  337  5e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  35.57 
 
 
826 aa  334  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  37.33 
 
 
764 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  37.07 
 
 
764 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  41.09 
 
 
820 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  37.1 
 
 
739 aa  327  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  37.44 
 
 
751 aa  325  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  35.2 
 
 
834 aa  320  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  37.06 
 
 
756 aa  319  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  35.9 
 
 
748 aa  313  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  36.49 
 
 
726 aa  306  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  35.42 
 
 
777 aa  300  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  37.49 
 
 
817 aa  287  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  36 
 
 
779 aa  261  4e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  45.01 
 
 
953 aa  254  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.87 
 
 
762 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  33.1 
 
 
822 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  47.23 
 
 
745 aa  229  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  32.71 
 
 
798 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  32.12 
 
 
719 aa  190  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  30.42 
 
 
840 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  30.37 
 
 
856 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  25.27 
 
 
557 aa  59.3  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.14 
 
 
548 aa  56.2  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  30.46 
 
 
548 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  32.43 
 
 
550 aa  51.2  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  30.46 
 
 
551 aa  51.2  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  33.33 
 
 
557 aa  48.5  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 
558 aa  47.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  29.61 
 
 
602 aa  47.8  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  31.53 
 
 
550 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  32.43 
 
 
561 aa  46.6  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5357  hypothetical protein  33.91 
 
 
449 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
545 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  27.81 
 
 
548 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  31.53 
 
 
548 aa  45.8  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  23.32 
 
 
818 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 
555 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  28.48 
 
 
554 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  32.43 
 
 
548 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>