18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0562 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  59.93 
 
 
298 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  57.44 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  56.7 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  50.35 
 
 
291 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  38.54 
 
 
290 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  38.19 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  37.07 
 
 
304 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  37.2 
 
 
296 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  34.39 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  35.53 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  35.89 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  32.42 
 
 
286 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  25.57 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  41.11 
 
 
332 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  28.47 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  26.14 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2159  hypothetical protein  24.38 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.290579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>