12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0258 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0258  AIG2 family protein  100 
 
 
195 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6070  AIG2 family protein  54.33 
 
 
144 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0560  AIG2-like  50 
 
 
150 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39079  predicted protein  40.91 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00259256  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2461  hypothetical protein  34.31 
 
 
164 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0553  AIG2 family protein  37.93 
 
 
365 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1655  AIG2 family protein  37.61 
 
 
112 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00480  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
684 aa  48.5  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2255  AIG2 family protein  26.56 
 
 
133 aa  48.1  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00405279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2381  AIG2 family protein  31.13 
 
 
133 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0302  hypothetical protein  32.63 
 
 
122 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.252086  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4897  hypothetical protein  26.73 
 
 
106 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.376181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>