25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3573 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  100 
 
 
814 aa  1588    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  39.38 
 
 
713 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  31.02 
 
 
706 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  32.02 
 
 
835 aa  189  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  29.5 
 
 
870 aa  138  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  32.79 
 
 
820 aa  127  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  28.11 
 
 
884 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  27.39 
 
 
919 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  26.86 
 
 
703 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  26.93 
 
 
751 aa  81.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  25.63 
 
 
728 aa  80.5  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  26.99 
 
 
764 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  29.32 
 
 
711 aa  78.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  26.8 
 
 
741 aa  77.4  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  37.27 
 
 
706 aa  73.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  27.43 
 
 
784 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  24.21 
 
 
718 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  29.52 
 
 
831 aa  68.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  27.51 
 
 
717 aa  65.1  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  24.02 
 
 
873 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  25.55 
 
 
820 aa  58.9  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  27.4 
 
 
802 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  31.28 
 
 
804 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  35.14 
 
 
905 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29 
 
 
2449 aa  47.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>