46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3295 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  100 
 
 
857 aa  1598    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  58.7 
 
 
789 aa  795    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  51.53 
 
 
790 aa  629  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  40.78 
 
 
837 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  40.3 
 
 
876 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  46.97 
 
 
789 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  41.8 
 
 
761 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  44.01 
 
 
751 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  46.08 
 
 
747 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  44.37 
 
 
752 aa  362  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  44.75 
 
 
758 aa  345  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  40.56 
 
 
820 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  41.25 
 
 
764 aa  323  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  41.32 
 
 
764 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  41.32 
 
 
739 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  40.73 
 
 
751 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  37.67 
 
 
777 aa  302  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  34.23 
 
 
826 aa  296  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  39.77 
 
 
758 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  39.03 
 
 
756 aa  291  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  43.62 
 
 
820 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  38.15 
 
 
748 aa  278  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.63 
 
 
834 aa  277  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  40.5 
 
 
817 aa  269  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  40.33 
 
 
762 aa  268  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  42.41 
 
 
953 aa  263  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  33.33 
 
 
759 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  39.62 
 
 
726 aa  244  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  46.68 
 
 
745 aa  234  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  36.04 
 
 
779 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  33.27 
 
 
822 aa  184  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  34.82 
 
 
798 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  30.86 
 
 
840 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  34.58 
 
 
856 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  32.73 
 
 
719 aa  157  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.36 
 
 
548 aa  54.3  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  35.03 
 
 
550 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.14 
 
 
555 aa  48.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  34.15 
 
 
550 aa  48.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.24 
 
 
550 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  30 
 
 
548 aa  47.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  22.3 
 
 
557 aa  46.6  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  33.33 
 
 
554 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  34.15 
 
 
561 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  29.53 
 
 
548 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
551 aa  45.8  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>