13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1273 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1273  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  621  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2648  hypothetical protein  47.06 
 
 
339 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1210  hypothetical protein  35.07 
 
 
321 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0200595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4240  NADH dehydrogenase (quinone)  36.44 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0108  hypothetical protein  36.41 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24460  hypothetical protein  32.57 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.760342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3222  hypothetical protein  29.07 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1387  hypothetical protein  34.59 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1109  hypothetical protein  34.27 
 
 
333 aa  59.3  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1107  hypothetical protein  32.48 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2757  hypothetical protein  29.46 
 
 
154 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2409  hypothetical protein  28.66 
 
 
328 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03580  hypothetical protein  32.46 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>