13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3222 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3222  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  633  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24460  hypothetical protein  35.51 
 
 
339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.760342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1109  hypothetical protein  33.01 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334333  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1387  hypothetical protein  31.19 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1107  hypothetical protein  35.33 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0108  hypothetical protein  33.93 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2648  hypothetical protein  31.14 
 
 
339 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05080  hypothetical protein  34.81 
 
 
151 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.730131  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2409  hypothetical protein  26.53 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4240  NADH dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1273  hypothetical protein  40.26 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03580  hypothetical protein  29.51 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1210  hypothetical protein  29.53 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0200595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>