18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2757 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2757  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  312  9.999999999999999e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1003  hypothetical protein  37.95 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2402  hypothetical protein  34.29 
 
 
189 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235922  normal  0.46952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3327  hypothetical protein  35.12 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2978  hypothetical protein  32.53 
 
 
167 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0340407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0587  hypothetical protein  33.93 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2403  hypothetical protein  29.27 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16004  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1878  hypothetical protein  25.32 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130485  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2315  hypothetical protein  24.68 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1401  hypothetical protein  32.52 
 
 
303 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00291068  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0108  hypothetical protein  29.89 
 
 
337 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2648  hypothetical protein  24.76 
 
 
339 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03580  hypothetical protein  27.68 
 
 
327 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1387  hypothetical protein  31.25 
 
 
331 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4240  NADH dehydrogenase (quinone)  25.23 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1109  hypothetical protein  30.53 
 
 
333 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334333  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1273  hypothetical protein  26.37 
 
 
334 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04985  hypothetical protein  26.67 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>