46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0621 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  170  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  87.34 
 
 		 79 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  86.25 
 
 		 80 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  87.34 
 
 		 82 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  83.75 
 
 		 82 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  83.75 
 
 		 82 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  73.75 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  64.47 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  59.21 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  58.67 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  57.33 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  55.13 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  52.56 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  49.33 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  51.28 
 
 		 85 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  46.84 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  51.28 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  53.42 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  46.84 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  48.68 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  48.68 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  50.65 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  48.72 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  48.72 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  51.95 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  46.75 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  44.3 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  41.25 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  46.67 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  51.25 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  54.55 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  42.47 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  48.05 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  45.45 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  31.03 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  38.96 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  34.15 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  32.88 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0304  hypothetical protein  41.33 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0405  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0051  hypothetical protein  47.73 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461056  normal  0.538804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>