31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2743 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2743  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  321  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.79466  normal  0.376957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2868  hypothetical protein  81.76 
 
 
155 aa  263  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0692  hypothetical protein  74.03 
 
 
154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454115  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1175  hypothetical protein  74.32 
 
 
152 aa  245  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3433  hypothetical protein  72.97 
 
 
152 aa  244  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.703957  normal  0.315896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1247  hypothetical protein  71.62 
 
 
152 aa  240  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4188  hypothetical protein  68.24 
 
 
152 aa  229  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310798  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5360  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0813424 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5839  hypothetical protein  45.07 
 
 
172 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1412  hypothetical protein  46.48 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.298721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1132  hypothetical protein  46.48 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1267  hypothetical protein  43.06 
 
 
155 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583955  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4954  hypothetical protein  46.53 
 
 
161 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.655771  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1416  hypothetical protein  41.55 
 
 
190 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161022  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4639  hypothetical protein  42.47 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4011  hypothetical protein  42.75 
 
 
172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.498018  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0281  hypothetical protein  43.84 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0844  hypothetical protein  48.82 
 
 
162 aa  124  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356671  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3610  hypothetical protein  39.73 
 
 
154 aa  124  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0570  hypothetical protein  39.73 
 
 
154 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3320  hypothetical protein  39.73 
 
 
154 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03515  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151082  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3427  hypothetical protein  42.22 
 
 
154 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4444  hypothetical protein  42.22 
 
 
154 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.810887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0575  hypothetical protein  42.22 
 
 
154 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3729  hypothetical protein  40.58 
 
 
172 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442699  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1061  hypothetical protein  40.6 
 
 
161 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.726656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02995  hypothetical protein  41.75 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2121  hypothetical protein  35.9 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.71998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2097  hypothetical protein  35.04 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0808696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0482  hypothetical protein  59.52 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>