68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2355 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  82.9 
 
 		 271 aa  474  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.91 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.73 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.03 
 
 		 276 aa  391  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.82 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  68.7 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.97 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.67 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  70.11 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.35 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.35 
 
 		 264 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.32 
 
 		 264 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  70.16 
 
 		 279 aa  384  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.97 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.97 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.97 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.91 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.28 
 
 		 263 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  69.23 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.11 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.11 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.34 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.11 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.46 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.43 
 
 		 264 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.08 
 
 		 264 aa  374  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.11 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.67 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.46 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  65.9 
 
 		 276 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.05 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.05 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.29 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  58.56 
 
 		 270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.14 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.14 
 
 		 271 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  45.8 
 
 		 252 aa  235  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1085  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.9 
 
 		 129 aa  52  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000176984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3365  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.19 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000484703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  26.83 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.4 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17591  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.52127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.13 
 
 		 123 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2122  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.27 
 
 		 124 aa  46.2  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000043873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4891  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.45 
 
 		 123 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.86 
 
 		 124 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000012378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5061  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.13 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5446  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.13 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1608  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.18 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000721312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1455  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.43 
 
 		 126 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1282  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.32 
 
 		 125 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020687  hitchhiker  0.00001458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5626  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.21 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000593222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1640  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.6 
 
 		 126 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000847698  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5378  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 		 123 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0674  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.86 
 
 		 126 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.94469  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1664  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.29 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5333  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.41 
 
 		 123 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17791  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.27 
 
 		 144 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.899684  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1650  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.57 
 
 		 123 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0987244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>