18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0921 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  100 
 
 
161 aa  321  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  31.54 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  35.56 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  34.81 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0888  FlgN family protein  35.33 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0650773  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  24.65 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  26.24 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  26.24 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  28.91 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  25.53 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  25.53 
 
 
155 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3028  FlgN family protein  28.68 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3047  FlgN family protein  28.68 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2414  FlgN  28.68 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1316  FlgN family protein  25.16 
 
 
141 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1324  FlgN family protein  25.16 
 
 
141 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1254  FlgN family protein  25.16 
 
 
141 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1951  FlgN  22.7 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>