21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0200 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  77.03 
 
 
75 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  74.32 
 
 
75 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  62.32 
 
 
75 aa  97.1  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  59.46 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  42.62 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  47.37 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  35.48 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  48.21 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  46.43 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  44.64 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  46.43 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  47.62 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0105  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2785  hypothetical protein  48.72 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.253251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  35.29 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  31.67 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  30 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  37.93 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  35.48 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  38.33 
 
 
107 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>