17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2620 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2620  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  286  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1676  alpha/beta hydrolase  44.59 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135197  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3288  hypothetical protein  44.44 
 
 
239 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2913  hypothetical protein  44.05 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.504664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2870  hypothetical protein  31.43 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000300623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2896  hypothetical protein  44.05 
 
 
234 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000115341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2672  hypothetical protein  42.86 
 
 
251 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0230759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2624  alpha/beta hydrolase  42.86 
 
 
251 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000020158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2865  hypothetical protein  42.86 
 
 
251 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2881  hypothetical protein  42.86 
 
 
234 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1918  alpha/beta hydrolase  41.67 
 
 
233 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2593  alpha/beta hydrolase  41.67 
 
 
234 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00594196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2552  hypothetical protein  30.46 
 
 
235 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0154484  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1643  hypothetical protein  44.44 
 
 
241 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2225  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00324748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
271 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>