52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2354 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
147 aa  296  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  40.94 
 
 
165 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  37.06 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  40.56 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  34.04 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  35.77 
 
 
159 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  34.93 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  31.43 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  38.78 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  38.78 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  37.68 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  35.97 
 
 
146 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  33.8 
 
 
158 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  31.43 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  34.56 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  33.79 
 
 
157 aa  86.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  31.39 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  30.41 
 
 
151 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  31.33 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  35.88 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  32 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  32.28 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  29.63 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  28.08 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  31.82 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  33.08 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  34.06 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  31.11 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  33.58 
 
 
173 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  32.33 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  28.03 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  29.75 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  31.01 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  29.6 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  28.36 
 
 
154 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  31.62 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  31.78 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  33.86 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  30.43 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  28.08 
 
 
156 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  30.48 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  28.89 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  30.48 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  30.48 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  28.45 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  28.89 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  26.23 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31350  hypothetical protein  25.58 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0210  protein of unknown function DUF180  26.47 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.945041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0412  flagellar assembly protein FliW  30.1 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1592  flagellar assembly protein FliW  27.62 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>