21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1688 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1688  hypothetical protein  100 
 
 
566 aa  1114    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2039  hypothetical protein  21.74 
 
 
559 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00195767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3062  putative ABC transporter, permease  26.26 
 
 
554 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00181769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1890  hypothetical protein  27.27 
 
 
552 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3364  hypothetical protein  26.63 
 
 
552 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3126  ABC transporter permease  26.44 
 
 
552 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3033  ABC transporter permease  26.44 
 
 
552 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000402188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3361  hypothetical protein  26.44 
 
 
552 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3139  hypothetical protein  26.44 
 
 
552 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3386  hypothetical protein  26.44 
 
 
552 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3340  hypothetical protein  27.22 
 
 
552 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2121  putative ABC transporter, permease  24.49 
 
 
551 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3356  hypothetical protein  26.26 
 
 
552 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173371  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0542  hypothetical protein  30.32 
 
 
557 aa  87.4  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.237787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0196  putative ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0298  uncharacterized membrane protein, putative  25.89 
 
 
532 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0303  putative ABC transporter permease protein  26.96 
 
 
532 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3007  hypothetical protein  21.04 
 
 
528 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00741341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15300  hypothetical protein  22.08 
 
 
534 aa  53.9  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0408  hypothetical protein  22.86 
 
 
553 aa  44.3  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2748  hypothetical protein  23.86 
 
 
529 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>