31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11958 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11958  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0608324  normal  0.971894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1443  hypothetical protein  42.31 
 
 
211 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.210948  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3408  hypothetical protein  44.04 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2927  hypothetical protein  39.2 
 
 
210 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0292  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0865  hypothetical protein  44.38 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.642531  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2970  hypothetical protein  43.14 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0094971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4607  hypothetical protein  37.68 
 
 
210 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0303145  hitchhiker  0.0000208711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3035  hypothetical protein  36.49 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2240  hypothetical protein  35.58 
 
 
209 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.168407  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0267  hypothetical protein  34.58 
 
 
207 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6520  hypothetical protein  38.53 
 
 
240 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.223836  normal  0.0543517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1682  hypothetical protein  35.75 
 
 
214 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.087821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3182  hypothetical protein  41.15 
 
 
209 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.429032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3229  hypothetical protein  41.54 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1677  hypothetical protein  34.78 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.47521e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0630  hypothetical protein  33.64 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12830  conserved hypothetical protein TIGR03085  39.38 
 
 
248 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.213535  normal  0.0190582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2192  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5808  hypothetical protein  37.56 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15570  conserved hypothetical protein TIGR03085  38.21 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2229  hypothetical protein  38.42 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1129  hypothetical protein  31.63 
 
 
225 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20820  conserved hypothetical protein TIGR03085  35.68 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.395226  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0463  hypothetical protein  34.29 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.78842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0452  hypothetical protein  34.29 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3980  hypothetical protein  38.81 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10040  hypothetical protein  36.32 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305113  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0439  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.471698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1996  hypothetical protein  35 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1770  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>