20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2254 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2254  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  904    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.121888  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1131  hypothetical protein  43.36 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.208354  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1345  hypothetical protein  44.75 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14831  hypothetical protein  42.37 
 
 		 575 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1482  hypothetical protein  29.87 
 
 		 521 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2849  hypothetical protein  30.3 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4019  hypothetical protein  28.22 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3977  hypothetical protein  28.22 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1604  hypothetical protein  30.25 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1701  hypothetical protein  28.41 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0255631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2145  hypothetical protein  28.64 
 
 		 452 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.657234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1112  hypothetical protein  27.86 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0734  hypothetical protein  28.26 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.746599  normal  0.256321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4015  hypothetical protein  26.82 
 
 		 454 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.768941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1188  hypothetical protein  27.89 
 
 		 599 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4321  hypothetical protein  27.51 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127881  hitchhiker  0.00787899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4261  hypothetical protein  27.51 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0714  hypothetical protein  28.69 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08961  hypothetical protein  27.93 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1951  hypothetical protein  26.11 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.816658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>