87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1583 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  41.72 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  43.71 
 
 
167 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  40.69 
 
 
159 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  38.64 
 
 
151 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  50.96 
 
 
147 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  38.93 
 
 
146 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  49.04 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  49.04 
 
 
147 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  35.57 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  41.67 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  29.41 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  45.97 
 
 
149 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.54 
 
 
171 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  26.92 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  30.63 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  41.48 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  36.29 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  29.48 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  32.17 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  26.71 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  26.55 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  26.9 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  31.3 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  26.85 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  29.55 
 
 
208 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  23.7 
 
 
218 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  30.43 
 
 
228 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  61.6  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  61.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  25.57 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  31.53 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  24.32 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  31.03 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  31.03 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  25.76 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  34.68 
 
 
192 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  29.07 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  31.3 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  23.53 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  34.11 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  30.28 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  39.68 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  29.51 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
386 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  27.68 
 
 
177 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
395 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  28.07 
 
 
196 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  27.68 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  23.48 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  30.4 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  31.58 
 
 
163 aa  50.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  31.78 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.54 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
401 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  30.56 
 
 
180 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  30.46 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  28.68 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  24.62 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  26.04 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  27.68 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  26.28 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  20.95 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  38.71 
 
 
197 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  38.71 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  28.68 
 
 
169 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  25.49 
 
 
165 aa  44.3  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  25.18 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  19.85 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  29.37 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  26.52 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  29.37 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  28.47 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  25.47 
 
 
397 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  34.72 
 
 
182 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  24.64 
 
 
176 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  26.61 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>