63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1503 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  100 
 
 		 259 aa  511  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  68.73 
 
 		 259 aa  384  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  68.34 
 
 		 259 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  66.02 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  68.73 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  63.32 
 
 		 259 aa  361  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  65.12 
 
 		 259 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  65.12 
 
 		 259 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  43.08 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  45.35 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  40.08 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  43.41 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  38.22 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.76 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  33.97 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  33.96 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  37.11 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  34.87 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  32.39 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  33.2 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  34.54 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.66 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  33.6 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  34.63 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  31.45 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.2 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  32.08 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  30.17 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.19 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  29.02 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  30.45 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  32.13 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.81 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  32.13 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  33.68 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  33.68 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  33.68 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  30.58 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  34.01 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  29.15 
 
 		 263 aa  95.5  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  31.06 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  31.06 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  34.01 
 
 		 255 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.58 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.85 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.85 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  26.42 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  24.8 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  27.93 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  21.92 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  27.5 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  28.19 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  27.35 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  31.33 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  29.06 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  29.08 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.5 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>