12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0273 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0273  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  303  7e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0244  hypothetical protein  90.13 
 
 
152 aa  277  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0398  hypothetical protein  55.41 
 
 
152 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3613  hypothetical protein  61.87 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2501  hypothetical protein  61.87 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3374  hypothetical protein  56.16 
 
 
154 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198947  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3698  hypothetical protein  54.36 
 
 
156 aa  167  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.383291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2152  hypothetical protein  56.43 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4315  hypothetical protein  55.03 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228058  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1001  hypothetical protein  55.71 
 
 
155 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.964836 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13920  predicted protein  38.32 
 
 
214 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000864813  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16334  predicted protein  38.68 
 
 
223 aa  81.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0892658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>