42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1269 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1269  inner membrane protein  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  54.75 
 
 		 280 aa  299  4e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  30.92 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  27.16 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  27.16 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  27.16 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  27.16 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  26.72 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  27.49 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  27.59 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  26.88 
 
 		 305 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  25.88 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  26.07 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  27.94 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  25.48 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  25.45 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  25.45 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  25.1 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  30.43 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  23.33 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  24.62 
 
 		 312 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  23.75 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  23.75 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  23.75 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  22.86 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  23.33 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  26.21 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  25.4 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  27.41 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  23.33 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  24.89 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  23.14 
 
 		 303 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  25.3 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  25 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  24.9 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  29.23 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  24.28 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  25.1 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  25.32 
 
 		 282 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  25.32 
 
 		 282 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>