25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4057 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  198  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  69.15 
 
 		 100 aa  141  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  67.71 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  70.65 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  64.58 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  68.13 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  65.26 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  64.52 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  62.22 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  67.47 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  64.84 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  71.21 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  68.18 
 
 		 74 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  56.79 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  44.71 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  34.83 
 
 		 228 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  38.98 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  40.7 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  58.06 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  35.94 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  58.06 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  54.84 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  38.24 
 
 		 116 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1797  protein of unknown function UPF0153  53.12 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>