19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3809 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3809  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.376862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3811  hypothetical protein  43.56 
 
 
187 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.379378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5210  hypothetical protein  33.77 
 
 
153 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.765726  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3176  hypothetical protein  34.64 
 
 
235 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298691  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0477  hypothetical protein  24.03 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2658  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2528  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0501  hypothetical protein  24.24 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3749  hypothetical protein  39.22 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2094  hypothetical protein  40.43 
 
 
274 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.390033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2070  hypothetical protein  40.43 
 
 
274 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0509  hypothetical protein  32.26 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04797  hypothetical protein  48.57 
 
 
232 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0269206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3767  hypothetical protein  45.65 
 
 
279 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1598  hypothetical protein  43.48 
 
 
266 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3301  hypothetical protein  26.47 
 
 
274 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0148  hypothetical protein  27.16 
 
 
525 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444838  normal  0.443885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0421  hypothetical protein  23 
 
 
462 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6015  hypothetical protein  42.86 
 
 
238 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>