299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_R0044 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_R0044  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000655751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0072  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  94.83 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  90.28 
 
 		 72 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0099  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000545128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0097  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000640462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0064  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0073  tRNA-Glu  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0073  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0583233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0063  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0031  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0023  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.805524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0002  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00190124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0070  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924064  normal  0.541649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0050  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.652046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0048  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0028  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423864  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t31  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.281788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t38  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444842  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t40  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.1195  normal  0.0190117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t42  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0670416  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0023  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0052  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0025  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.797735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA60  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.095942  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R62  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23580  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0268964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27600  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0544848  hitchhiker  0.00250338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0074  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.562141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0081  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.863726  normal  0.5241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0079  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.672863  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0072  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1996  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2336  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0131684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>