12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2229 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  336  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2947  hypothetical protein  36.36 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  34.78 
 
 		 509 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  42.19 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 		 486 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  40 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  36.56 
 
 		 312 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  36.99 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  27.85 
 
 		 372 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  34.43 
 
 		 422 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  27.18 
 
 		 666 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>