27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2039 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2039  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1099    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00195767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2121  putative ABC transporter, permease  27.71 
 
 
551 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3340  hypothetical protein  27.59 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3139  hypothetical protein  26.86 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3386  hypothetical protein  26.86 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3361  hypothetical protein  26.86 
 
 
552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3033  ABC transporter permease  26.86 
 
 
552 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000402188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1890  hypothetical protein  26.44 
 
 
552 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3126  ABC transporter permease  26.86 
 
 
552 aa  213  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3364  hypothetical protein  26.86 
 
 
552 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3062  putative ABC transporter, permease  27.66 
 
 
554 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00181769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3356  hypothetical protein  26.86 
 
 
552 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0298  uncharacterized membrane protein, putative  26.36 
 
 
532 aa  173  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0303  putative ABC transporter permease protein  26.55 
 
 
532 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816814  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1688  hypothetical protein  21.22 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15300  hypothetical protein  24.47 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0196  putative ABC transporter, permease protein  24.46 
 
 
532 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0542  hypothetical protein  26.45 
 
 
557 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.237787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3007  hypothetical protein  21.78 
 
 
528 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00741341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4673  hypothetical protein  24.43 
 
 
524 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4583  permease  23.97 
 
 
526 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0750795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0277  hypothetical protein  23.33 
 
 
524 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0408  hypothetical protein  24.76 
 
 
553 aa  60.5  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1743  hypothetical protein  28.07 
 
 
508 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.169376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0570  hypothetical protein  24.5 
 
 
569 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0058  hypothetical protein  22.4 
 
 
614 aa  52  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2748  hypothetical protein  26.42 
 
 
529 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>