21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5301 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  47.5 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  42.15 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  47.15 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  47.15 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  47.15 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  38.21 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  37.29 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  45 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  34.75 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  30.89 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  36.36 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0674  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0198  hypothetical protein  30.25 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  31.3 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0150  hypothetical protein  31.07 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3057  hypothetical protein  32.48 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>