15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4617 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1345    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 630 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 649 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  28.38 
 
 		 634 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 650 aa  209  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  27.33 
 
 		 644 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  25.61 
 
 		 636 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  25.19 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  26.59 
 
 		 620 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  26.23 
 
 		 620 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  24.44 
 
 		 631 aa  141  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  24.96 
 
 		 612 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  26.38 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  36.92 
 
 		 476 aa  45.8  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0651  putative flavin-containing monooxygenase  36.84 
 
 		 500 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>